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di Giuseppe Striccoli

IV anno

ACIDI NUCLEICI: Struttura del DNA ora in JSmol

ACIDI NUCLEICI: Struttura del DNA ora in JSmol

 Il DNA è l’acido nucleico che codifica le informazioni riguardanti la sintesi delle proteine e degli acidi nucleici necessari alla loro sintesi, mRNA e tRNA. Chimicamente è un polimero formato da Quattro NUCLEOTIDI. Ogni nucleotide è formato da uno zucchero, il 2-Desossiribosio, zucchero a cinque […]

Cannabinoidi, endocannaiboidi, fitocannabinoidi e Cannabis in Jsmol

Cannabinoidi, endocannaiboidi, fitocannabinoidi e Cannabis in Jsmol

Il sistema cannobinoide endogeno, che prende il nome dalla pianta che portò alla loro scoperta, è uno dei più importanti sistemi fisiologici coinvolti nel creare e mantenere la salute umana. Gli endocannabinoidi ed i loro recettori si ritrovano in tutto il corpo: nel cervello, negli […]

Esercizi di stereoisomeria delle molecole biologiche principali in Jsmol

Esercizi di stereoisomeria delle molecole biologiche principali in Jsmol

La stereoisomeria è un tassello fondamentale nelle molecole biologiche. Gli zuccheri della serie D, gli amminoacidi della serie L, la configurazione solo CIS per gli acidi grassi: esempi del ruolo della stereoisomeria nel mondo del vivente e delle sue macromolecole. Sfrutteremo la proprietà introdotta da […]

Le regole della stereoisomeria di Cahn Prelog Ingold sui doppi legami

Le regole della stereoisomeria di Cahn Prelog Ingold sui doppi legami

La presenza di un doppio legame in una molecola impedisce la libera rotazione attorno al legame C-C e genera la possibilità di una forma di isomeria chiamata geometrica, cioè di avere due stereoisomeri con proprietà fisiche differenti. Di conseguenza è necessario assegnare mediante delle regole […]

Le Chitine ed il chitosano

Le Chitine ed il chitosano

Chimicamente la chitina è una catena di un derivato del glucosio chiamatop N acetilglucosammina, NAG, 2 acetilammino 2 deossi glucosio, e la si ritrova in tutto il mondo naturale. E’ un componente caratteristico della parete dei funghi, degli esoscheletri degli artropodi come i crostacei ed […]

I Betaglucani

I Betaglucani

I betaglucani sono costituiti da polisaccaridi con legami glicosidici Beta 1->3 e beta 1->4 tra unità di Dglucopiranosio in ordine che non si ripete ma che non è casuale. La fonte dei betaglucani sono le comuni graminacee che ne posseggono quantità variabili. Orzo 7%, avena […]

I polimeri cellulosici: carbossimetilcellulosa

I polimeri cellulosici: carbossimetilcellulosa

I polimeri cellulosici hanno una maggiore solubilità in acqua, perché vanno ad interferire con la formazione ordinata dei legami ad H. La Metilcellulosa, o E461 secondo la normativa europea, sintetizzata metilando il 30% dei gruppi OH, produce dei gel al di sopra di una certa […]

La struttura della cellulosa

La struttura della cellulosa

La cellulosa è un polimero lineare del cellobiosio, in cui si è già visto come il punto di polimerizzazione è la posizione 4 con legami acetalici di tipo 1-4 beta O. Generalmente i polimeri della cellulosa sono composti da 2000 fino a 14mila unità. Nelle […]

La pectina, un oligopolimero estratto dalla frutta

La pectina, un oligopolimero estratto dalla frutta

La pectina è un polimero di vari monosaccaridi che si ritrova nella frutta e in piante, come mela e buccia di limone. Costituisce dal 2% al 35% delle pareti cellulari delle piante. E’ importante per la crescita delle piante, la regolazione dello scambio di ioni […]

Struttura e proprietà degli Acidi carbossilici

Struttura e proprietà degli Acidi carbossilici

In questo semplice articolo proponiamo la struttura di alcuni acidi carbossilici noti di cui calcoliamo i dipoli e le cariche parziali su ogni atomo, affiancati dalla mappe di separazione di carica che ci evidenziano le zone ricche di carica positiva e quelle di carica negativa. […]

MEP, Le mappe dei potenziali elettrostatici

MEP, Le mappe dei potenziali elettrostatici

Le Mappe di potenziale elettrostatico MEP, conosciute anche come mappe di energia potenziale elettrostatica, o superfici di potenziale elettrico molecolare, mostrano le distribuzioni di carica delle molecole in tre dimensioni, permettendoci di visualizzare le differenti regioni di una molecola differentemente caricate. La conoscenza della distribuzione […]

I Galaxolidi ed odori in JSmol

I Galaxolidi ed odori in JSmol

I Galaxolidi sono dei muschi sintetico del gruppo dei policiclici , tipico muschio bianco , dall’odore di pulito, muschioso-floreale-legnoso con nuances dolci e polverose. Largamente usato ad una concentrazione fino al 40%, soprattutto negli ammorbidenti e detergenti per il bucato, ma anche nei profumi. Trésor […]

ALDEIDI E CHETONI: Tautomeria e Catalisi acida in JSmol

ALDEIDI E CHETONI: Tautomeria e Catalisi acida in JSmol

Dopo aver visto in un post precedente la struttura dello ione enolato, vediamo la tautomeria chetoenolica applicata al ciclopentanone con il meccanismo della catalisi acida. La formazione dell’enolo, infatti, può essere catalizzata sia in ambiente basico, con conseguente formazione di un carboanione, oppure in presenza […]

La Tautomeria cheto enolica: lo ione enolato JSMol

La Tautomeria cheto enolica: lo ione enolato JSMol

Studieremo la struttura dello ione enolato. Tra le reazioni caratteristiche delle aldeidi e dei chetoni, vi è la tautomeria chetoenolica. Possono esibire questa reazione quei composti carbonilici che hanno un H in alfa al carbonile. Una delle molecole possibili è l’etanale.

Superfici ed orbitali molecolari dei reattivi di Grignard in JSMol

Superfici ed orbitali molecolari dei reattivi di Grignard in JSMol

I composti di Grignard fanno parte della classe di reagenti metallo organici, derivati per reazione, in ambiente anidro e privo di CO2, del Mg metallico con alogenuri alchilici e arilici. Sono molto utili per formare legami Carbonio Carbonio. Si preparano in genere in etere anidro, […]

Alogenuri alchilici: Struttura, mappe molecolari ed Orbitali (JSmol)

Alogenuri alchilici: Struttura, mappe molecolari ed Orbitali (JSmol)

Gli alogenuri alchilici sono caratterizzati dall’avere un atomo di Alogeno (F, Cl, Br, I) legato ad un C ibridizzato SP3, mediante un legame covalente polare, dal momento che gli alogeni sono più elettronegativi del C, tranne forse l’I.

La struttura della DNA Polimerasi in JSMol

La struttura della DNA Polimerasi in JSMol

Le DNA polimeasi sono una classe specializzata di enzimi transferasi che catalizzano l’estensione, dipendente da uno stampo, di un filamento di DNA idoneo a partire da desossinucleosidi trifosfato. In questa visualizzazione si presenta il dominio della isonucleasi e la caratteristica topologia del dominio costituito da […]

Acetato di etile: orbitali molecolari e superfici molecolari in JSmol

Acetato di etile: orbitali molecolari e superfici molecolari in JSmol

Le strutture che qui esaminiamo sono tre e sono relative agli acidi carbossilici e derivati: l’acido acetico, la formammide, l’acetato di etile. I files con gli orbitali molecolari sono lavori originali del sito ChemMagic. Di queste quattro molecole saranno visualizzate le superfici elettrostatiche, MEP, sulla […]

ALDEIDI E CHETONI: addizione nucleofila acilica in JSmol

ALDEIDI E CHETONI: addizione nucleofila acilica in JSmol

Da quanto osservato in un precedente articolo qui postato, un comportamento chimico tipico del gruppo carbonilico è quello di dare reazioni di addizione nucleofila acilica, secondo due meccanismi distinti. Il primo prevede l’attacco di nucleofili forti,come i reattivi di Grignard, gli acetiluri o i carbanioni […]

Superfici ed orbitali molecolari di Aldeidi e chetoni in JSmol

Superfici ed orbitali molecolari di Aldeidi e chetoni in JSmol

Le strutture delle aldeidi e chetoni che qui esaminiamo sono tre: l’aldeide formica, la acetaldeide, l’acetone e la Benzaldedide. I files con gli orbitali molecolari e le superfici molecolari usati sono lavori originali del sito ChemMagic. Di queste quattro molecolesaranno visualizzate le superfici elettrostatiche MEP […]