JSmol è l’applicazione Javascript OpenSouce del visualizzatore di molecole Jmol che richiede JAVA.
Gira come applicativo di HTML5 nei principali web browser come Firefox, Chrome, Opera, Safari, MSIE(9+), su Ipad e Iphone.
Permette di visualizzare molecole, orbitali e mappe molecolari, strutture di proteine, enzimmi e tanto altro ancora in vari formati permettendo anche una grande operabilità sulla molecola stessa.
E’ possibile visualizzare angoli e lunghezze di legami, angoli di torsione, operatori di simmetria
L’enzima Malato deidrogenasi, MDH, catalizza reversibilmente l’ossidazione dell’ acido L-malico ad acido ossalacetato. Esso sfrutta il cofattore NAD+ come ossidante che si trasforma in NADH il quale poi sarà portato nella catena di trasporto di elettroni. Questo processo lo possiamo ritrovare in molto cicli metabolici tra cui l’acido citrico, nella… Read More »Malato deidrogenasi: da acido L-malico a ossalacetato
Il battere anaerobico Clostridium Tetani è in grado di produrre una neurotossina potente e anche mortale, la tetanospasmina. La tetanospasmina fa parte della famiglia delle neurotossine clostidriche, CNT. E’ l’agente che causa il Tetano, una malattia che in molti paesi sviluppati non è mortale, ma dove le strutture sanitarie sono… Read More »Tetanospasmina tossina del tetano, malattia mortale
La lattoferrina è una proteina della famiglia delle transferine che si trova nel latte, come anche nella saliva, nelle lacrime e nei fluidi di secrezione ed è responsabile del trasporto del Ferro nelle celle degli animali superiori. La lattoferrina controlla il rilascio del Ferro alle cellule e controlla il livello… Read More »Lattoferrina dal trasporto del ferro al sistema immunitario
Un riducente molto importante già conosciuto è l’Idruro di Litio e Alluminio, LiAlH4, che vedremo applicato nelle sintesi stereoselettive come nelle riduzioni asimmetriche di aldeidi e chetoni. LiAlH4 è sono una via molto importante per ottenere diasteroisomeri o enantiomeri differenti. Le riduzioni asimmetriche le possiamo avere anche con altri agenti… Read More »Riduzioni asimmetriche con LiAlH4 idruro di litio e alluminio
Dopo un periodo in cui i farmaci antivirali non sono stati molto ricercati, l’emergere del Covid-19 ha riposizionato l’attenzione di governi e ditte farmaceutiche sulla spesa per farmaci covid capaci di bloccare l’epidemia. Sebbene i vaccini contro il Covid-19 si siano dimostrati efficaci nel controllare la diffusione dell’epidemia ed evitare… Read More »I farmaci antivirali del COVID-19 in Jsmol 3D
La Flavina Adenina dinucleotide FAD è la forma ossidata di un gruppo protetico che partecipa alle reazioni di ossidoriduzione con specifica azione sui legami Carbonio-Carbonio.
Quando si ossida, Flavina Adenina dinucleotide si riduce a FADH2.
Esso è legato fortemente alla proteina in cui si trova come nel ciclo di Krebs o nella Beta ossidazione degli acidi grassi. Read More »Il cofattore FAD ed il suo enzima in Jsmol
L’influenza è una malattia contagiosa causata da un retrovirus, cioè un virus che il cui genoma è un filamento di RNA.
Il virus influenzale contiene solo otto proteine che sono codificate nel suo RNA.
Due di queste otto proteine si trovano sulla superficie della capsula del virus e sono due GLICOPROTEINE, la Emoagglutinina H e la Neuroamminidasi N.
Queste due proteine sono richieste per avere l’infezione e la diffusione in una specie animale.
La Hemmaglutinina attacca il virus agli acidi sialici sulla superficie delle cellule permettendo loro di entrare ed infettarle.
Dopo che si è avuta la replicazione, la neuraminidasi rimuove l’acido sialico dalla cellula permettendo il rilascio dei nuovi virioni assemblati che infettano altre cellule.
La Emagglutinina H e la Neuroamminidasi N dell’influenza A classificano il virus in sierotipi secondo il tipo di H (ce ne sono 16 tipi differenti) e di N (ce ne sono 9).
Si sa che l’influenza della Spagnola nel periodo 1918-1920 fu causato dal virus H1N1, mentre l’Asiatica del 1957-58 fu causato dal sierotipo H2N2 1957-58.Read More »Neuroaminidasi dell’influenza aviaria: struttura in Jsmol
L’enzima Piruvato Deidrogenasi E1 è uno dei tre componenti principali di un complesso a più enzimi chiamato Piruvato Deidrogenasi, a cui partecipano anche l’enzima E2 diidrolipoil transacetilasi ed E3 Diidrolipoil deidrogenasi. Il complesso enzimatico Piruvato Deidrogenasi dell’Escherichia Coli ha un peso di 4600 kD ed un diametro attorno ai 300… Read More »Enzima E1 della Piruvato deidrogenasi
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