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di Giuseppe Striccoli

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Le Basi azotate degli acidi nucleici in JSmol

Le Basi azotate degli acidi nucleici in JSmol

Le basi azotate rinvenibili negli acidi nucleici sono cinque: citosina, guanina, timina, adenida e uracile. A e G sono basi puriniche, mentre C e T sono basi pirimidiniche. L’uracile sostituisce la timina ne RNA, mentre i primi e quattro si trovano nel DNA. Esse sono […]

Le conformazioni del CICLOESANO in JSmol

Le conformazioni del CICLOESANO in JSmol

Il cicloesano (C6H12) è un cicloalcano saturo con Carboni ibridizzati sp3 ed una struttura che non presenta tensioni di anello tipiche del ciclopropano e ciclobutano. Fino al 1918, quando fu fatta l’analisi ai RaggiX del diamante e si dedusse la struttura tetraedrica del Carbonio, si […]

Le conformazioni degli Alcani in JSmol

Le conformazioni degli Alcani in JSmol

Il legame caratteristico di un ALCANO è un legame a simmetria SIGMA tra due legami sp3 di due carboni, con una energia media di legame di -83Kcal/mole ed una lunghezza media di legame di 1,54 nm. I gradi di libertà che la molecola ha sono […]

Struttura quaternaria dell’emoglobina

Struttura quaternaria dell’emoglobina

Qui presentiamo la struttura dell’emoglobina, una proteina di trasporto di tipo oligomerico, con struttura quaternaria, formata da quattro subunità di due tipi differenti, alfa e beta. La forma che qui presentiamo è nella forma di deoxiemoglobina, priva di Ossigeno. La sua struttura è tutta di […]

Struttura terziaria delle proteine: i Domini

Struttura terziaria delle proteine: i Domini

In questo articolo mostriamo alcuni tipi di domini e le proteine dove sono presenti. Essi formano la struttura terziaria che può essere composta da uno o più di essi. Nel primo esempio troviamo il monomero dell’enzima allosterico della piruvato chinasi del muscolo del gatto.

Struttura terziaria delle proteine in JSmol

Struttura terziaria delle proteine in JSmol

La struttura terziaria di una proteina è, come si è detto, la sua organizzazione complessiva nello spazio che ci permette di conoscere le coordinate di ogni singolo atomo. Può essere composta da uno o più domini che rappresentano un’organizzazione di più secondarie con una specifica […]

Struttura secondaria beta a pieghe delle proteine in JSmol

Struttura secondaria beta a pieghe delle proteine in JSmol

La struttura secondaria di una proteina è, come si è detto, la sua organizzazione locale in una sequenza di amminoacidi. La seconda struttura analizzata è detta beta a pieghe,in cui i legami ad Idrogeno si formano tra due porzioni della struttura primaria della proteina che […]

Strutture secondarie delle proteine: alfa eliche destrose in JSmol

Strutture secondarie delle proteine: alfa eliche destrose in JSmol

La struttura secondaria delle proteine è, come si è detto, la sua organizzazione locale in una sequenza di amminoacidi. La prima struttura analizzata è detta alfa elica, la struttura più presente nelle proteine, che si forma in seguito a dei parametri degli angoli di psi […]

I livelli delle strutture tridimensionali delle Proteine in JSmol

I livelli delle strutture tridimensionali delle Proteine in JSmol

Le funzioni che assume una proteina possono essere comprese solo a partire dalla sua struttura e dalla sua complessità. Sono state determinate le strutture tridimensionali di molte proteine e sono stati desunti alcuni principi generali. La struttura di una proteina ha vari livelli. Struttura primaria, […]

Gli amminoacidi classificazione e struttura in JSmol

Gli amminoacidi classificazione e struttura in JSmol

Le proteine sono polimeri degli alfa amminoacidi che hanno un gruppo amminico sul carbonio in posizione alfa al gruppo carbossilico e su cui è presente una catena laterale R, come nella figura. In natura nelle proteine esisono 20 differenti tipi di ammino-acidi che tra loro […]