L’enzima Citrato Sintasi in JSmol

citratointetasiQui è visualizzata la citrato sintetasi estratta dal Thermus Thermophilus, a cui sono legati l’acido citrico e il Coenzima A che sono i primi prodotti del ciclo di Krebs.
L’acido citrico si forma per azione dell’acetilcoenzima A che è entrato carbonile sull’acido ossalacetico.
L’energia libera standard (ΔG°’) della reazione è di -31.5kJ/mol, un valore molto negativo ad indicare che funziona lontano dalla condizione di equilibrio sotto le condizioni fisiologiche, e quindi sarà un enzima determinante nel ciclo.
Forse i più importanti regolatori della reazione sono i suoi substrati che sono entrambi presenti nel mitocondrio a concentrazioni sotto il livello di saturazione dell’enzima. Il flusso metabolico è controllato dalla facilità di trovare il substrato e quindio mediante il controllo dei livelli di AcetilcoeA e ossalacetato nel mitocondrio si controlla la velocità di reazione. Inoltre l’enzima è inibito da NADH, citrato e succinilcoenA (inibizione da feedback competitivo).
Lo schema della reazione è il seguente


I substrati che portano all’acido citrico sono ed .
L’enzima che catalizza la reazione è . Qui sono legati gli ioni solfato di cristallizzazione. Nessun NADH o Coenzima A.
. Si notino le quattro subunità colorate secondo i quattro colori.
Questa invece è una singola.
Ad essa sono legatiQuesta è invece il tetramero completo con i leganti.
La sacca dei leganti è qui
Qui viene presentata nel suo funzionamento, tra la forma T, dove è legato il citrato e non attiva, e la forma R dove sono entrati i substrati

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