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Neuroaminidasi dell’influenza aviaria: struttura in Jsmol

influenza

neuraminidasiL’influenza è una malattia contagiosa causata da un retrovirus, cioè un virus che il cui genoma è un filamento di RNA.

Ci sono quattro tipi di influenza, e quella definita influenza A è la più virulenta negli esseri umani.

Il virus influenzale contiene solo otto proteine che sono codificate nel suo RNA.
Due di queste otto proteine si trovano sulla superficie della capsula del virus e sono due GLICOPROTEINE, la Emoagglutinina H e la Neuroamminidasi N.

Queste due proteine sono richieste per avere l’infezione e la diffusione in una specie animale.

La Hemmaglutinina attacca il virus agli acidi sialici sulla superficie delle cellule permettendo loro di entrare ed infettarle.

Dopo che si è avuta la replicazione, la neuraminidasi rimuove l’acido sialico dalla cellula permettendo il rilascio dei nuovi virioni assemblati che infettano altre cellule.

La Emagglutinina H e la Neuroamminidasi N dell’influenza A classificano il virus in sierotipi secondo il tipo di H (ce ne sono 16 tipi differenti) e di N (ce ne sono 9).

Si sa che l’influenza della Spagnola nel periodo 1918-1920 fu causato dal virus H1N1, mentre l’Asiatica del 1957-58 fu causato dal sierotipo H2N2 1957-58.

Qui è visualizzata la Neuraminidasi del Virus dell’influenza aviaria, un omotetramero di uno stesso monomero su cui è legato un farmaco Osltamivir. Per visualizzare il sito attivo e le interazioni farmaco proteina si clicchi sul tasto neuraminidasi che visualizzerà un solo monomero.

Sulla neuraminidasi si sono concentrate le ricerche sui possibili inibitori usati come farmaci antivirali
Ogni monomero ha un sito catalitico dove, almeno in questo modello, è legato il tamilflu

L’enzima è formato quasi del tutto da beta a pieghe e solo da alcune piccole eliche. La parte dell’enzima dove è legato il farmaco è la parte che si conserva sempre in tutte le variazioni della proteina.
Visualizziamo il singolo monomero con il farmaco inibitore legato .
In quest’altra visione si può vedere che il sito attivo risiede in una buca – -Visione in volume della
Cliccando su questo link vediamo i residui di Amminoacidi che legano il farmaco, mentre con l’altro vediamo i

Lavoro originale Proteopedia