La quinta regola CIP di Cahn Ingold Prelog, come detto precedentemente, si applica quando le regole precedenti di definizione del descrittore della Configurazione Assoluta NON possono più applicarsi e non portano a nulla.
La quinta regola CIP dice:
Descrittori di atomi o gruppi R, M o Seqcis precedono S, P e Seqtrans rispettivamente
L’articolo generale sulle regole CIP e link lo trovate qui
Il primo esempio di questa quinta regola è quello del (2R,3r,4S)-pentan-2,3,4-triolo, un caso tipico di poliolo, che presenta 2 c asimmetrici ed il C3 PSEUDOASIMMETRICO e che può essere r oppure s e dare due differenti diasteroisomeri. (2R,3r,4S)-pentan-2,3,4-triolo
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Nel secondo esempio abbiamo un composto in cui il Centro stereogeno è legato a due sistemi allenici M o P, il (3M,5r,7P)-5-etil-5-metilnona-2,3,6,7-tetraene
(3M,5r,7P)-5-etil-5-metilnona-2,3,6,7-tetraene
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Nel terzo caso abbiamo (4S,2Z,5E)-hepta-2,5-dien-4-olo in cui il Centro stereogeno è legato a due centri stereogeni EZ. Il C4 è Chirale
Dopo che si sono applicate esaustivamente le quattro regole precedenti, si applica la Regola 5. Il carbonio di mezzo C3 è stereogenico e achirotopico, cioè genera degli stereoisomeri ma NON è centro chirale. Vale a dire è PSEUDOASIMMETRICO perché è legato a due gruppi immagini speculari
la cui configurazione è determinata con con regola 1a. Le priorità sono al C3 O > R > S > H. C3 avrà configurazione
La configurazione degli ultimi due centri è determinata
Centri MP
Nel secondo esempio abbiamo un composto in cui il Centro stereogeno è legato a due sistemi allenici M o P, il (3M,5r,7P)-5-etil-5-metilnona-2,3,6,7. Il nel composto bis allenico è anche stereogenico e achirotopico, PSEUDOASIMMETRICO. . I due residui allenici C3 e C7 sono enantiomerici e di configurazione M e P. Le priorità al C5 sono M > P > C2H5 > CH3. I residui allenici hanno la priorità su etili e metili per la regola 1a.Il C5 sarà percio di configurazione
Centri E-Z
Nel terzo caso abbiamo (4S,2Z,5E)-hepta-.
Il C4 del dienolo è legato a due doppi legami stereogeni che rendono il C4 CHIRALE.
Le priorità sono O > Z > E > H. Configurazione del C4 sarà s.
(2R,3r,4S)-pentan-2,3,4-triolo 
(3M,5r,7P)-5-etil-5-metilnona-2,3,6,7-tetraene 