JSmol è l’applicazione Javascript OpenSouce del visualizzatore di molecole Jmol che richiede JAVA.
Gira come applicativo di HTML5 nei principali web browser come Firefox, Chrome, Opera, Safari, MSIE(9+), su Ipad e Iphone.
Permette di visualizzare molecole, orbitali e mappe molecolari, strutture di proteine, enzimmi e tanto altro ancora in vari formati permettendo anche una grande operabilità sulla molecola stessa.
E’ possibile visualizzare angoli e lunghezze di legami, angoli di torsione, operatori di simmetria
Nella applet seguente verranno visualizzati gli orbitali molecolari di una molecola biatomica. Senza voler qui entrare nella trattazione, visualizzeremo solo le superfici di contorno di tali orbitali. Il differente colore che porteranno i lobi stanno ad indicare le diverse fasi degli orbitali, i diversi segni matematici, non la presenza o… Read More »Legame chimico: Orbitali Molecolari in JSmol
Nella applet seguente verranno visualizzati gli orbitali atomici ibridi più tipici del legame chimico, e considereremo un elemento generico del II periodo della Tavola Elettronica, a cui appartiene il Carbonio. L’ibridizzazione è una combinazione lineare di orbitali atomici naturali utile a spiegare sia la lunghezza dei legami sia gli angoli… Read More »Orbitali atomici ibridi più comuni in JSmol
Nella applet di sotto verranno visualizzati gli orbitali atomici originali dell’atomo di Idrogeno fino al livello n=3 e dell’atomo di cloro fino ad n=4, come calcolati dall’equazione di Schroedinger. Il primo orbitale è l'unico orbitale, a simmetria sferica (l=0), del livello quantico n=1. Questo è l'orbitale a simmetria sferica (l=0)… Read More »Orbitali atomici non ibridizzati di Idrogeno e Cloro
Il calore di idrogenazione si forma dalla reazione di idrogenazione degli alcheni, che è una reazione catalizzata da alcuni metalli a formare il composto saturo relativo, un alcano. E’ un processo termodinamicamente favorito perché porta ad un composto con energia minore, ed è una reazione esotermica secondo lo schema qui… Read More »Dati Termodinamici del calore di idrogenazione degli alcheni
L’ amido è la biomolecola più abbondante sulla terra dopo la cellulosa e il più importante carboidrato di riserva per molte piante a tubero e nell’endosperma dei semi. Nei semi lo si trova in granuli ognuno dei quali è tipicamente composto di vari milioni di molecole di amilopectine da un… Read More »Struttura dell’amido
I disaccaridi più importanti che consideriamo sono maltosio, cellobiosio, saccarosio e lattosio. Tutti i disaccaridi ad eccezione del cellobiosio sono dimeri in cui è presente l’anomero alfa D + glucosio. Nel cellobiosio è presente l’anomero beta, termodinamicamente più stabile. Il cellobiosio, quando polimerizza, dà origine alla cellulosa. Il lattosio è… Read More »I disaccaridi in JSmol
La struttura presentata sotto è la struttura lineare del D (+)Glucosio nella sua forma aldeidica. Quando è posta in acqua, essa dà luogo ad un equilibrio emiacetalico formando una coppia di diasteroisomeri, detti anomeri alfa e beta. I centri di reazione sono l’OH in viola sul C che dà il… Read More »Gli anomeri del Glucosio e Fruttosio
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